兩年后，施瑯攻打澎湖，獲知鄭克塽確定投降的消息后，英國東印度公司駐臺灣商館人員很緊張，幾次派人到澎湖和施瑯商談。施瑯簽發一紙命令，讓他們張貼在商館墻上，以免遭到清朝士兵侵擾。

施瑯畫像

施瑯原名施郎，福建晉江人。早年是鄭芝龍的部將，曾隨之降清；后投靠鄭成功，擔任左先鋒，因父親與兄弟為鄭成功所殺，1651年再次降清，是明鄭降將中主張用武力剿滅鄭氏最激烈者，但不受重視。直到1681年，康熙皇帝成年主政后，采納姚啟圣和李光地的建議，起用施瑯出任福建水師提督一職，1683年出征臺灣。(第18代孫施永龍先生提供)

等到施瑯來臺灣后，先是威脅英國人違法供給武器彈藥給鄭經、對清朝皇帝抱有敵意，要將他們下獄；要英國人繳出目前存放于商館的全部商品明細，且須繳納一筆不菲的傭金，他就會向清政府說好話免去他們的罪行，而康熙皇帝若想跟任何歐洲人從事交易，英國人也能通過他享受到利益；但若英國人拒絕，就沒收一切財產，把他們交由朝廷處置。基于恐懼，英國商館人員只好乖乖奉上這筆傭金。

鄭克塽率眾回到中國大陸后，施瑯參與了臺灣善后處理事務，開始籌劃讓英國東印度公司在福建籌設商館，為了隱瞞英、鄭雙方通商的事實，施瑯命手下擬了一封信說這些英國商館人員是海難中漂流到廈門的，之后逃抵臺灣，生活很辛苦。他要求英國商館人員在信上簽名，以便送交康熙皇帝。

施瑯讓福建總督姚啟圣將這封信轉給康熙皇帝，再讓英國人以感謝救助為由，通過福建向北京朝貢。最終待北京認可，建立合法的貿易關系。

這個計謀卻遭到姚啟圣反對，加上后來康熙確定開放海禁，派遣戶部人員前來管理稅務機關，施瑯連忙將已重返廈門開設商館的英國人趕走，英國人一離開商館，原地立即轉設為廈門稅務機關，以掩蓋施瑯走私貿易的事實。

最后，英國東印度公司不但沒有討回鄭經積欠的龐大債務，廈門和臺灣的商館又被清軍占據，在臺灣開設12年的英國商館在1684年封館，被迫撤離。

英國既然通過鄭經到了廈門，并打開與中國貿易的大門，到口的肥肉當然不會輕易放棄，因此仍繼續在廈門、廣州和澳門尋找做生意的機會。英國的臺灣商館封館15年后，英國商船邁克萊斯菲號終于到了廣州，直接將中國的絲、茶和瓷器出口到歐洲，后來更在廣州設立商館11，定期貿易期間，英國商人被允許長住廣州，非貿易期間則居住在澳門。

18世紀20年代前后，茶葉取代絲織品，成為中國第一大出口商品，英國東印度公司則全力經營茶葉的出口。18世紀中葉，英國在中國的貿易量已超過了西方各國的總和。

有了國家力量的支持，英國持續擴大在中國的貿易量，甚至走私鴉片，后來因欽差大臣林則徐銷毀英國商人的鴉片，英國對中國發動鴉片戰爭；清朝政府戰敗后，香港島成為英國殖民地。戰后，西方列強跟隨著英國的腳步，開始不客氣地蠶食鯨吞中國領土。