2013年，孫耀琦受邀參加湖南衛視《一生一世合家歡》節目錄制，現場與遲帥攜手共同演繹了一段搞笑浪漫的“情侶秀”，兩人因各自的精彩表現被觀眾稱贊為優質偶像組合 ;5月參加明星模仿秀節目《百變大咖秀》的錄制，現場模仿反串林志穎 ;8月，憑借在古裝網絡劇《我為宮狂》中飾演從三百年前穿越到現代的純真可愛、對愛情執著的女一號琉璃一角受到頗高人氣 ;隨后在歷史傳奇劇《武松》中飾演最萌版潘金蓮 。2014年3月，孫耀琦憑借在古裝劇《隋唐英雄4》中飾演亦剛亦柔、文武雙全的樊梨花一角受到觀眾的好評 ;6月，在與唐嫣、楊洋合作出演季播懸疑網絡劇《盜墓筆記》中飾演原創角色陳丞澄;7月，主演古裝喜劇《神醫大道公前傳》，孫耀琦在劇中一人分飾兩角，角色之一是天庭上高貴淑雅的仙女無弦公主，而另一個角色卻是個潑辣搞怪、大大咧咧的市井妹子鮑大銀 ;12月，出演古裝武俠劇《神雕俠侶》，飾演陸家莊千金小姐陸無雙 。